Il modo più semplice per arrivare in treno è direttamente da
Tokyo Skytree Station, oppure con circa 5 minuti a piedi da
Oshiage (Skytree-mae) Station sulle linee Hanzomon, Asakusa e Keisei. Dal lato di
Asakusa basta 1 fermata con la
Tobu Skytree Line, ed è anche per questo che l'acquario si abbina così bene a
金龍山 浅草寺 e
Asakusa Shrine. Se arrivi in auto, usa i parcheggi di
Tokyo Skytree Town; non c'è un parcheggio dedicato all'acquario.